Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBC4

PRICKLE4, Prickle-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE4Q2TBC4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRICKLE4Q2TBC4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRICKLE4Q2TBC4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRICKLE4Q2TBC4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRICKLE4Q2TBC4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRICKLE4Q2TBC4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRICKLE4Q2TBC4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRICKLE4Q2TBC4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRICKLE4Q2TBC4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms