Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB90

HKDC1, Putative hexokinase HKDC1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKDC1Q2TB90 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HKDC1Q2TB90 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HKDC1Q2TB90 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HKDC1Q2TB90 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HKDC1Q2TB90 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HKDC1Q2TB90 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HKDC1Q2TB90 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms