Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC6LQ2NKX8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6LQ2NKX8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC6LQ2NKX8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC6LQ2NKX8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms