Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSPP1Q1MSJ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSPP1Q1MSJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSPP1Q1MSJ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms