Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPN21Q16825 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPN21Q16825 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN21Q16825 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN21Q16825 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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