Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST2H2ACQ16777 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIST2H2ACQ16777 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H2ACQ16777 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms