Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCBQ16585 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCBQ16585 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCBQ16585 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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