Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms