Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYPL1Q16563 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms