Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNGA3Q16281 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNGA3Q16281 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGA3Q16281 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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