Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CHRNA2Q15822 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CHRNA2Q15822 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHRNA2Q15822 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHRNA2Q15822 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms