Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPTX1Q15818 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPTX1Q15818 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPTX1Q15818 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms