Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP4Q15650 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIP4Q15650 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP4Q15650 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIP4Q15650 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP4Q15650 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIP4Q15650 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIP4Q15650 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIP4Q15650 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIP4Q15650 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIP4Q15650 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIP4Q15650 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIP4Q15650 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIP4Q15650 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIP4Q15650 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIP4Q15650 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIP4Q15650 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP4Q15650 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP4Q15650 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP4Q15650 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIP4Q15650 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms