Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNHIT3Q15649 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT3Q15649 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT3Q15649 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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