Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NFIXQ14938 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFIXQ14938 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NFIXQ14938 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NFIXQ14938 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms