Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNIQ14094 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNIQ14094 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms