Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKP1Q13835 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28■■■□□ 2.07
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PKP1Q13835 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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PKP1Q13835 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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PKP1Q13835 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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PKP1Q13835 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PKP1Q13835 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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