Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TPBGQ13641 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPBGQ13641 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPBGQ13641 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPBGQ13641 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TPBGQ13641 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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