Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PKD2Q13563 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
PKD2Q13563 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PKD2Q13563 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PKD2Q13563 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
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