Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTM1Q13496 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTM1Q13496 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTM1Q13496 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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