Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRSF5Q13243 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRSF5Q13243 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms