Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTF3Q12996 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTF3Q12996 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTF3Q12996 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
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