Protein–RNA interactions for Protein: Q12972

PPP1R8, Nuclear inhibitor of protein phosphatase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R8Q12972 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP1R8Q12972 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP1R8Q12972 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP1R8Q12972 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP1R8Q12972 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R8Q12972 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R8Q12972 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R8Q12972 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R8Q12972 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R8Q12972 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R8Q12972 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R8Q12972 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms