Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN13Q12923 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN13Q12923 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN13Q12923 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPN13Q12923 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN13Q12923 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN13Q12923 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPN13Q12923 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPN13Q12923 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPN13Q12923 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN13Q12923 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPN13Q12923 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN13Q12923 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN13Q12923 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN13Q12923 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPN13Q12923 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPN13Q12923 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN13Q12923 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPN13Q12923 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN13Q12923 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN13Q12923 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPN13Q12923 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN13Q12923 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN13Q12923 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN13Q12923 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPN13Q12923 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN13Q12923 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN13Q12923 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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