Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX4Q12846 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX4Q12846 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX4Q12846 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX4Q12846 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX4Q12846 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX4Q12846 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX4Q12846 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX4Q12846 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX4Q12846 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX4Q12846 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX4Q12846 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX4Q12846 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX4Q12846 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX4Q12846 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX4Q12846 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX4Q12846 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX4Q12846 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX4Q12846 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX4Q12846 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX4Q12846 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX4Q12846 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX4Q12846 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX4Q12846 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX4Q12846 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX4Q12846 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX4Q12846 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX4Q12846 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX4Q12846 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX4Q12846 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX4Q12846 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX4Q12846 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX4Q12846 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX4Q12846 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX4Q12846 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX4Q12846 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX4Q12846 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX4Q12846 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STX4Q12846 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX4Q12846 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX4Q12846 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX4Q12846 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX4Q12846 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX4Q12846 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STX4Q12846 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STX4Q12846 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX4Q12846 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STX4Q12846 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX4Q12846 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX4Q12846 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX4Q12846 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX4Q12846 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX4Q12846 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX4Q12846 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX4Q12846 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX4Q12846 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX4Q12846 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX4Q12846 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX4Q12846 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX4Q12846 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX4Q12846 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STX4Q12846 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STX4Q12846 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX4Q12846 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX4Q12846 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX4Q12846 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX4Q12846 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX4Q12846 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX4Q12846 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
STX4Q12846 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
STX4Q12846 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX4Q12846 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX4Q12846 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX4Q12846 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX4Q12846 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STX4Q12846 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STX4Q12846 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX4Q12846 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX4Q12846 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX4Q12846 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX4Q12846 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX4Q12846 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX4Q12846 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX4Q12846 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX4Q12846 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX4Q12846 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX4Q12846 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX4Q12846 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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