Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFEMP1Q12805 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFEMP1Q12805 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFEMP1Q12805 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFEMP1Q12805 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFEMP1Q12805 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFEMP1Q12805 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFEMP1Q12805 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFEMP1Q12805 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFEMP1Q12805 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFEMP1Q12805 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFEMP1Q12805 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFEMP1Q12805 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EFEMP1Q12805 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFEMP1Q12805 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFEMP1Q12805 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFEMP1Q12805 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFEMP1Q12805 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFEMP1Q12805 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFEMP1Q12805 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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