Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CPSF1Q10570 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CPSF1Q10570 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CPSF1Q10570 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CPSF1Q10570 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CPSF1Q10570 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
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