Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPAL4Q0D2K0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPAL4Q0D2K0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NIPAL4Q0D2K0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms