Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC38A11Q08AI6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC38A11Q08AI6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms