Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNB2Q08289 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNB2Q08289 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACNB2Q08289 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNB2Q08289 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms