Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PDE4BQ07343 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE4BQ07343 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE4BQ07343 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PDE4BQ07343 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms