Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CXCL9Q07325 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CXCL9Q07325 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CXCL9Q07325 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms