Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CALD1Q05682 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CALD1Q05682 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CALD1Q05682 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CALD1Q05682 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms