Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPN12Q05209 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
PTPN12Q05209 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
PTPN12Q05209 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms