Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 CDC16YKL022C 2523 nt7.23□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 HHY1YEL059W 309 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 CBP4YGR174C 513 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 LEU5YHR002W 1074 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 YLR123CYLR123C 330 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 AAD15YOL165C 432 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 RKI1YOR095C 777 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 DAP1YPL170W 459 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 YTH1YPR107C 627 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 PUF3YLL013C 2640 nt7.22□□□□□ -1.25
SYF1Q04048 NTG1YAL015C 1200 nt7.21□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 YLR312CYLR312C 1197 nt7.21□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 GSH1YJL101C 2037 nt7.21□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 QCR8YJL166W 285 nt7.2□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 MRPL22YNL177C 930 nt7.2□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 TKL2YBR117C 2046 nt7.2□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 HSM3YBR272C 1443 nt7.19□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 TSA1YML028W 591 nt7.19□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 HAP3YBL021C 435 nt7.19□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt7.19□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 PMT3YOR321W 2262 nt7.18□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 NTE1YML059C 5040 nt7.18□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 YEL068CYEL068C 333 nt7.18□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 GPH1YPR160W 2709 nt7.18□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 TMT1YER175C 900 nt7.17□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 PUS5YLR165C 765 nt7.17□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 IES2YNL215W 963 nt7.17□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 RGT2YDL138W 2292 nt7.17□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 ECM30YLR436C 3825 nt7.17□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 MDH3YDL078C 1032 nt7.16□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 MRP17YKL003C 396 nt7.16□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 AIM33YML087C 939 nt7.16□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 ERG12YMR208W 1332 nt7.16□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 WHI2YOR043W 1461 nt7.16□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 AFG1YEL052W 1530 nt7.16□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 YCK1YHR135C 1617 nt7.16□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 CCP1YKR066C 1086 nt7.15□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 YPR114WYPR114W 948 nt7.15□□□□□ -1.26
SYF1Q04048 RAD24YER173W 1980 nt7.15□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 ADY2YCR010C 852 nt7.14□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 FHN1YGR131W 525 nt7.14□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 GPB2YAL056W 2643 nt7.14□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 ATP4YPL078C 735 nt7.14□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 GDA1YEL042W 1557 nt7.13□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 UTR2YEL040W 1404 nt7.13□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 GTT3YEL017W 1014 nt7.13□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 GAT4YIR013C 366 nt7.13□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 MEU1YLR017W 1014 nt7.13□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 GPA1YHR005C 1419 nt7.12□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 IME2YJL106W 1938 nt7.12□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.12□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 YGR022CYGR022C 330 nt7.12□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 DAL3YIR032C 588 nt7.12□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 UBC11YOR339C 471 nt7.12□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 SKY1YMR216C 2229 nt7.12□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 SRF1YDL133W 1314 nt7.11□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 EFM4YIL064W 774 nt7.11□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 YTP1YNL237W 1380 nt7.1□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 RSP5YER125W 2430 nt7.1□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 BUD9YGR041W 1644 nt7.09□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 RRP46YGR095C 672 nt7.09□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 ARG1YOL058W 1263 nt7.09□□□□□ -1.27
SYF1Q04048 PNP1YLR209C 936 nt7.08□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 ASN2YGR124W 1719 nt7.07□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 ARP2YDL029W 1176 nt7.07□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 PHB1YGR132C 864 nt7.07□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 HGH1YGR187C 1185 nt7.07□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 BCY1YIL033C 1251 nt7.07□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 LDB18YLL049W 540 nt7.07□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt7.06□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt7.06□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 NMD5YJR132W 3147 nt7.06□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 YOS9YDR057W 1629 nt7.05□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 ATG4YNL223W 1485 nt7.05□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 OPI8YKR035C 642 nt7.05□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 RPL21AYBR191W 483 nt7.05□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 KTR3YBR205W 1215 nt7.05□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 PRP2YNR011C 2631 nt7.05□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 SEC23YPR181C 2307 nt7.05□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt7.04□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 QCR6YFR033C 444 nt7.04□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 YGL235WYGL235W 537 nt7.04□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 DCN1YLR128W 810 nt7.04□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 SEC13YLR208W 894 nt7.04□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 YHM2YMR241W 945 nt7.04□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 GLN1YPR035W 1113 nt7.04□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 YML133CYML133C 4125 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 RQC1YDR333C 2172 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 PYC2YBR218C 3543 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 CNE1YAL058W 1509 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 YFL064CYFL064C 525 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 VMA16YHR026W 642 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 PAN6YIL145C 930 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 YIR042CYIR042C 711 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 SYN8YAL014C 768 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 YKL031WYKL031W 414 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 COX5AYNL052W 462 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 CAR1YPL111W 1002 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 YPR202WYPR202W 717 nt7.03□□□□□ -1.28
SYF1Q04048 YBR144CYBR144C 315 nt7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.9 ms