Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A3Q01959 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A3Q01959 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A3Q01959 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A3Q01959 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A3Q01959 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC6A3Q01959 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A3Q01959 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A3Q01959 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A3Q01959 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms