Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
XPCQ01831 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
XPCQ01831 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
XPCQ01831 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
XPCQ01831 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
XPCQ01831 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
XPCQ01831 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
XPCQ01831 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
XPCQ01831 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
XPCQ01831 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
XPCQ01831 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
XPCQ01831 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
XPCQ01831 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
XPCQ01831 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
XPCQ01831 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
XPCQ01831 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
XPCQ01831 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
XPCQ01831 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
XPCQ01831 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
XPCQ01831 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
XPCQ01831 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
XPCQ01831 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
XPCQ01831 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
XPCQ01831 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
XPCQ01831 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
XPCQ01831 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
XPCQ01831 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
XPCQ01831 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
XPCQ01831 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
XPCQ01831 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
XPCQ01831 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
XPCQ01831 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
XPCQ01831 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
XPCQ01831 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
XPCQ01831 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
XPCQ01831 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
XPCQ01831 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
XPCQ01831 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
XPCQ01831 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
XPCQ01831 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
XPCQ01831 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
XPCQ01831 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
XPCQ01831 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
XPCQ01831 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
XPCQ01831 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
XPCQ01831 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
XPCQ01831 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
XPCQ01831 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
XPCQ01831 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
XPCQ01831 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
XPCQ01831 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
XPCQ01831 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
XPCQ01831 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
XPCQ01831 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
XPCQ01831 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
XPCQ01831 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
XPCQ01831 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
XPCQ01831 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
XPCQ01831 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
XPCQ01831 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
XPCQ01831 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
XPCQ01831 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
XPCQ01831 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
XPCQ01831 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
XPCQ01831 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
XPCQ01831 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
XPCQ01831 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
XPCQ01831 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
XPCQ01831 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
XPCQ01831 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
XPCQ01831 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
XPCQ01831 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
XPCQ01831 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
XPCQ01831 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
XPCQ01831 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
XPCQ01831 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
XPCQ01831 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
XPCQ01831 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
XPCQ01831 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
XPCQ01831 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
XPCQ01831 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
XPCQ01831 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
XPCQ01831 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
XPCQ01831 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
XPCQ01831 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
XPCQ01831 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
XPCQ01831 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
XPCQ01831 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
XPCQ01831 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
XPCQ01831 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
XPCQ01831 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
XPCQ01831 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
XPCQ01831 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
XPCQ01831 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
XPCQ01831 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
XPCQ01831 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
XPCQ01831 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
XPCQ01831 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
XPCQ01831 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
XPCQ01831 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms