Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA6Q01524 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA6Q01524 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms