Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX1Q01196 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX1Q01196 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX1Q01196 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms