Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRCDQ00LT1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRCDQ00LT1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRCDQ00LT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms