Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFI35P80217 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFI35P80217 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFI35P80217 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFI35P80217 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFI35P80217 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFI35P80217 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFI35P80217 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFI35P80217 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFI35P80217 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFI35P80217 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFI35P80217 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFI35P80217 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFI35P80217 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFI35P80217 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFI35P80217 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFI35P80217 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IFI35P80217 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFI35P80217 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFI35P80217 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFI35P80217 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFI35P80217 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFI35P80217 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFI35P80217 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFI35P80217 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFI35P80217 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFI35P80217 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFI35P80217 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFI35P80217 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFI35P80217 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFI35P80217 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFI35P80217 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFI35P80217 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFI35P80217 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFI35P80217 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFI35P80217 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFI35P80217 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFI35P80217 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFI35P80217 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFI35P80217 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFI35P80217 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFI35P80217 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFI35P80217 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFI35P80217 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFI35P80217 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFI35P80217 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFI35P80217 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFI35P80217 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFI35P80217 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFI35P80217 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFI35P80217 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFI35P80217 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFI35P80217 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFI35P80217 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFI35P80217 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFI35P80217 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFI35P80217 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFI35P80217 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFI35P80217 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IFI35P80217 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFI35P80217 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFI35P80217 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFI35P80217 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFI35P80217 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFI35P80217 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFI35P80217 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFI35P80217 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFI35P80217 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFI35P80217 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFI35P80217 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFI35P80217 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFI35P80217 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFI35P80217 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFI35P80217 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFI35P80217 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFI35P80217 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFI35P80217 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFI35P80217 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFI35P80217 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFI35P80217 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFI35P80217 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFI35P80217 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFI35P80217 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFI35P80217 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFI35P80217 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFI35P80217 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFI35P80217 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFI35P80217 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFI35P80217 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFI35P80217 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFI35P80217 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFI35P80217 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFI35P80217 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFI35P80217 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFI35P80217 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFI35P80217 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFI35P80217 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFI35P80217 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFI35P80217 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFI35P80217 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms