Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX4P78413 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX4P78413 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX4P78413 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX4P78413 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX4P78413 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX4P78413 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX4P78413 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX4P78413 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX4P78413 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX4P78413 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX4P78413 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX4P78413 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX4P78413 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX4P78413 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX4P78413 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX4P78413 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX4P78413 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX4P78413 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX4P78413 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX4P78413 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX4P78413 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX4P78413 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX4P78413 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX4P78413 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX4P78413 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX4P78413 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX4P78413 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX4P78413 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX4P78413 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX4P78413 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX4P78413 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX4P78413 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX4P78413 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX4P78413 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX4P78413 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX4P78413 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX4P78413 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX4P78413 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX4P78413 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX4P78413 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX4P78413 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRX4P78413 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX4P78413 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX4P78413 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX4P78413 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX4P78413 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX4P78413 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX4P78413 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX4P78413 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX4P78413 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX4P78413 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX4P78413 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX4P78413 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRX4P78413 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX4P78413 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX4P78413 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX4P78413 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX4P78413 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRX4P78413 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX4P78413 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX4P78413 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX4P78413 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX4P78413 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX4P78413 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX4P78413 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX4P78413 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX4P78413 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX4P78413 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRX4P78413 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX4P78413 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX4P78413 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX4P78413 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX4P78413 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX4P78413 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRX4P78413 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX4P78413 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX4P78413 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX4P78413 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRX4P78413 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX4P78413 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX4P78413 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX4P78413 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX4P78413 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRX4P78413 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX4P78413 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX4P78413 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRX4P78413 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms