Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3BP2P78314 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2P78314 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2P78314 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms