Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTA1P68133 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTA1P68133 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTA1P68133 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTA1P68133 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTA1P68133 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTA1P68133 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTA1P68133 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTA1P68133 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTA1P68133 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTA1P68133 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTA1P68133 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTA1P68133 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTA1P68133 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTA1P68133 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTA1P68133 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTA1P68133 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTA1P68133 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTA1P68133 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTA1P68133 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTA1P68133 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTA1P68133 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTA1P68133 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTA1P68133 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTA1P68133 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTA1P68133 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTA1P68133 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTA1P68133 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTA1P68133 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTA1P68133 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTA1P68133 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTA1P68133 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTA1P68133 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTA1P68133 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTA1P68133 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTA1P68133 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTA1P68133 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTA1P68133 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTA1P68133 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTA1P68133 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTA1P68133 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACTA1P68133 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTA1P68133 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTA1P68133 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTA1P68133 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTA1P68133 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms