Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKP1P63208 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SKP1P63208 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKP1P63208 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKP1P63208 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKP1P63208 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKP1P63208 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKP1P63208 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SKP1P63208 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKP1P63208 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKP1P63208 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKP1P63208 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKP1P63208 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKP1P63208 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SKP1P63208 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKP1P63208 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKP1P63208 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKP1P63208 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKP1P63208 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKP1P63208 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKP1P63208 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKP1P63208 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKP1P63208 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKP1P63208 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKP1P63208 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKP1P63208 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKP1P63208 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKP1P63208 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKP1P63208 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKP1P63208 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKP1P63208 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKP1P63208 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SKP1P63208 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKP1P63208 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKP1P63208 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKP1P63208 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKP1P63208 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKP1P63208 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKP1P63208 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKP1P63208 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKP1P63208 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKP1P63208 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKP1P63208 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKP1P63208 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SKP1P63208 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKP1P63208 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKP1P63208 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKP1P63208 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKP1P63208 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKP1P63208 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SKP1P63208 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKP1P63208 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKP1P63208 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKP1P63208 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKP1P63208 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKP1P63208 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKP1P63208 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKP1P63208 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKP1P63208 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKP1P63208 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKP1P63208 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKP1P63208 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKP1P63208 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKP1P63208 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKP1P63208 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKP1P63208 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKP1P63208 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKP1P63208 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKP1P63208 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKP1P63208 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKP1P63208 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SKP1P63208 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKP1P63208 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKP1P63208 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKP1P63208 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKP1P63208 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKP1P63208 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKP1P63208 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKP1P63208 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKP1P63208 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SKP1P63208 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKP1P63208 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SKP1P63208 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKP1P63208 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKP1P63208 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKP1P63208 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKP1P63208 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKP1P63208 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKP1P63208 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKP1P63208 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKP1P63208 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKP1P63208 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKP1P63208 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKP1P63208 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKP1P63208 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKP1P63208 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SKP1P63208 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKP1P63208 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKP1P63208 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKP1P63208 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms