Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERVK_113P61574 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P61574 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms