Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVPABLB-1P60509 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERVPABLB-1P60509 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVPABLB-1P60509 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms