Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DEFA1P59665 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DEFA1P59665 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DEFA1P59665 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms