Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRG3P56975 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRG3P56975 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRG3P56975 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRG3P56975 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRG3P56975 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRG3P56975 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRG3P56975 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRG3P56975 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRG3P56975 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRG3P56975 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRG3P56975 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRG3P56975 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRG3P56975 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRG3P56975 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRG3P56975 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRG3P56975 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRG3P56975 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRG3P56975 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRG3P56975 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRG3P56975 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRG3P56975 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NRG3P56975 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRG3P56975 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NRG3P56975 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRG3P56975 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRG3P56975 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRG3P56975 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NRG3P56975 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRG3P56975 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NRG3P56975 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRG3P56975 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRG3P56975 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRG3P56975 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRG3P56975 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRG3P56975 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRG3P56975 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NRG3P56975 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NRG3P56975 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRG3P56975 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRG3P56975 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NRG3P56975 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRG3P56975 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRG3P56975 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NRG3P56975 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRG3P56975 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRG3P56975 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRG3P56975 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRG3P56975 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRG3P56975 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRG3P56975 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRG3P56975 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRG3P56975 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NRG3P56975 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NRG3P56975 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRG3P56975 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRG3P56975 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRG3P56975 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRG3P56975 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRG3P56975 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRG3P56975 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRG3P56975 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRG3P56975 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRG3P56975 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRG3P56975 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NRG3P56975 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRG3P56975 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRG3P56975 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRG3P56975 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRG3P56975 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRG3P56975 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRG3P56975 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRG3P56975 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRG3P56975 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRG3P56975 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRG3P56975 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRG3P56975 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRG3P56975 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NRG3P56975 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRG3P56975 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRG3P56975 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRG3P56975 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRG3P56975 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRG3P56975 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NRG3P56975 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRG3P56975 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRG3P56975 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRG3P56975 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRG3P56975 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NRG3P56975 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRG3P56975 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRG3P56975 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRG3P56975 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRG3P56975 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NRG3P56975 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRG3P56975 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRG3P56975 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRG3P56975 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NRG3P56975 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRG3P56975 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms