Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA1P56199 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA1P56199 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA1P56199 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms