Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCL23P55773 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCL23P55773 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCL23P55773 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCL23P55773 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCL23P55773 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCL23P55773 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCL23P55773 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCL23P55773 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL23P55773 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL23P55773 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL23P55773 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL23P55773 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL23P55773 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL23P55773 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCL23P55773 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCL23P55773 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCL23P55773 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCL23P55773 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCL23P55773 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL23P55773 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL23P55773 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL23P55773 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL23P55773 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL23P55773 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL23P55773 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL23P55773 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL23P55773 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL23P55773 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCL23P55773 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL23P55773 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL23P55773 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL23P55773 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL23P55773 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL23P55773 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL23P55773 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL23P55773 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL23P55773 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL23P55773 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCL23P55773 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL23P55773 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL23P55773 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL23P55773 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL23P55773 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL23P55773 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCL23P55773 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCL23P55773 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCL23P55773 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCL23P55773 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCL23P55773 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCL23P55773 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCL23P55773 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL23P55773 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL23P55773 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCL23P55773 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL23P55773 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL23P55773 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL23P55773 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL23P55773 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL23P55773 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL23P55773 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCL23P55773 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCL23P55773 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCL23P55773 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCL23P55773 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCL23P55773 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL23P55773 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL23P55773 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL23P55773 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL23P55773 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCL23P55773 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCL23P55773 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCL23P55773 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCL23P55773 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCL23P55773 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCL23P55773 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCL23P55773 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCL23P55773 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCL23P55773 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCL23P55773 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCL23P55773 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCL23P55773 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCL23P55773 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCL23P55773 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCL23P55773 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCL23P55773 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms